Die Ermittlungen zum Flydubai-Angriff erweiterten sich, als die Schulung des mutmasslichen Entführers in Neuseeland unter die Lupe genommen wurde. Die Behörden Neuseelands initiierten eine eigene Untersuchung bezüglich des Co-Piloten, der angeblich versuchte, ein Flugzeug in Richtung Israel zu entführen. Die Polizei bestätigte, dass der Pilot dort Flugtraining absolvierte, etwa ein Jahr nach seiner Aufgabe eines Studiums in Australien.
Das Unglück wurde am 30. September knapp verhindert, als Passagiere und Besatzungsmitglieder den angeblichen Versuch des Co-Piloten, Hamam al-Hammami, 29 Jahre alt, die Kontrolle eines Fluges mit 182 Personen nach Tel Aviv zu übernehmen, verhinderten. Der Staatsanwalt der Vereinigten Arabischen Emirate erklärte, dass Hammami bei dem angeblichen Terroranschlag eine Absturzkeule eingesetzt hatte und der Pilot mitten in der Luft gestochen worden war.
Israelische und regionale Beamte vermuteten ursprünglich, dass er den Anschlag im Juli geplant hatte, dieser Plan jedoch verschob. Der Polizeibeamter Michael Johnson bestätigte am Dienstag, dass der Pilot für 175 Tage in Neuseeland auf einem Studentenvisum verweilte, von dem 30. November 2018 bis zum 23. Mai 2019. Johnson erklärte in einer Stellungnahme, dass die Polizei die Zeit des Mannes im Land untersuchte.
Parallel dazu starteten australische Sicherheitsbehörden eine Untersuchung, nachdem bekannt wurde, dass Hammami etwa zwei Jahre als Student in dem Land verbracht hatte, bis 2017. Die RMIT University in Melbourne bestätigte, dass er das Land verließ, ohne seinen Ingenieurabschluss zu erwerben. Auf einem nun gelöschten Social-Media-Profil, das Hammami zugeschrieben wurde, erschien der ehemalige Student in einem Selfie mit anderen Jugendlichen in einem Einkaufszentrum in Melbourne.
Die Telegraph des Vereinigten Königreichs berichtete über einen Beitrag auf einem nun gelöschten X-Konto, der seine Jahre des Studiums im Ausland als „die goldenen Jahre meines religiösen Engagements“ bezeichnete und behauptete, er werde weniger pflichtbewusst, als er nach Oman zurückkehrte. Die Exekutive des australischen jüdischen Verbandes rief am Mittwoch zu einer gründlichen Untersuchung seiner Verbindungen in dem Land auf. Der Co-Vorsitzende Alex Ryvchin betonte, dass man verstehen müsse, wer mit diesem angeblichen Terroristen verbunden war, wer ihn beeinflusst hatte und welche Überreste seiner mörderischen Ideologie verblieben seien.
Der Kapitän des Flugzeugs, Smit Machchhar, der ebenfalls eine Zeit lang in Neuseeland trainiert hatte, berichtete am Samstag, dass er kurz nachdem Hammami seinen Platz verlassen hatte, um zu beten, einen „großen Schlag“ auf die Rückseite seines Kopfes empfand. In einem Telefongespräch mit dem Premierminister Benjamin Netanyahu erklärte Machchhar: „Die Schläge kamen weiter… Dann erkannte ich, dass es nicht das Flugzeug war, sondern der andere Mann, der mit mir in der Cockpit saß.“ Nach seinen Verletzungen konnte Machchhar die Sicherheitsdörrer der Cockpit freigeben, um die Passagiere zu ermöglichen, Hammami zu überwinden. Ein Reserv pilot der Flydubai, der auf dem Flug reiste, übernahm die Kontrolle über das Flugzeug und landete es in einem regionalen Flughafen in Nordwest-Saudi-Arabien, wo der Co-Pilot von saudischen Behörden festgehalten wurde.