Das interne Kontrollgremium des Verteidigungsministeriums eröffnete eine Untersuchung, um festzustellen, ob US-Militärbefehlshaber bei der Durchführung von Bootangriffen in der Karibik und im östlichen Pazifik die vorgeschriebenen Verfahren eingehalten hatten. Die Inspektion der Generalstaatsanwaltschaft prüfte, ob die Kommandanten die sechsstufige Prozedur befolgten, die die US-Streitkräfte vor der Genehmigung und Durchführung tödlicher Angriffe einhalten mussten. Diese Überprüfung umfasste Operationen der US-Südkommandostruktur, welche die militärische Tätigkeit in dieser Region überwachte und ihren Sitz in Doral, Florida, hatte.
Die Operation „Southern Spear“, eine militärische Kampagne zur Zerstörung von Booten im Karibischen Meer, löste massiven Unmut aus und Anschuldigungen gegen die Verletzung des internationalen Rechts. Die Regierung Trump bezeichnete die Aktion als Bemühung, „Narco-Trafficker“ aus Lateinamerika auf ihrem Weg in die Vereinigten Staaten zu bekämpfen. Bis zu diesem Zeitpunkt führte die US-Streitkraft mindestens 58 Angriffe durch, welche 193 Todesopfer, darunter 13 vermisste oder mutmaßlich Tote, nach sich zogen.
Humanrechtsorganisationen und internationale Gremien verurteilten die Angriffe als exekutivrechtliche Tötungen und als Verstoß gegen das US- und internationales Recht. Eine gemeinsame Untersuchung, die von Journalisten geleitet wurde, identifizierte dreizehn der Opfer und stellte fest, dass diese aus äußerst armen Gemeinschaften stammten und kaum einen Zusammenhang mit organisierten Drogennetzwerken besaßen. Berichte beschrieben die Opfer als Tagelohner, die aus Verzweiflung Arbeit auf den Booten suchten, nicht als Akteure mit Bedeutung in der Drogenwirtschaft.
Familien von einigen der Opfer reichten Klagen gegen die US-Regierung ein und behaupteten, die Angriffe seien rechtswidrig gewesen. Demokraten versuchten wiederholt, die tödliche Operation durch den Kongress einzudämmen. Ein Gesetzesvorschlag zur Verhinderung weiterer Angriffe ohne kongressuelle Genehmigung scheiterte im Senat mit 51 zu 48. Der Senat lehnte zudem zweimal Vorschläge ab, die die Befugnis der Regierung zur Fortsetzung militärischer Maßnahmen einschränken sollten.
Im Dezember äußerte sich der Vorsitzende des Senatsausschusses für Streitkräfte, Roger Wicker, als Republikaner aus Mississippi, in seiner Kommission, die „keinen Beweis für Kriegsverbrechen“ fand. Gleichzeitig kritisierte der französische Außenminister Jean-Noël Barrot bei einer G7-Sitzung im November, dass die Angriffe internationales Recht verletzten und die Region destabilisierten. Der Kolumbienpräsident Gustavo Petro forderte zudem einen Strafprozess gegen Donald Trump wegen der Angriffe an der UN-Generalversammlung im September.
Die Inspektion der Generalstaatsanwaltschaft vollzog ihre Überprüfung im Pentagon und im Hauptquartier der Südkommandostruktur und forderte hochrangige Beamte auf, innerhalb von fünf Tagen Kontaktpunkte zu benennen.