Der leitende Polizeidetektiv Frans Mathipa kämpfte vier Monate lang um Zugang zu entscheidenden Informationen in seinem Fall. Er befürchtete jedoch, dass seine Ermittlungen sein Leben kosten würden. Zwei Tage später fand sein Auto umgestoßen. Mathipa wurde während der Fahrt erschossen. Sieben Mitglieder der südlichen Afrikanischen Spezialeinheiten sowie ein Militärpolizeibeamter wurden im August 2023 wegen des Mordes an Oberstleutnant Mathipa angeklagt. Die Angeklagten wiesen die Anschuldigungen entschieden zurück.
Eine umfangreiche Sammlung von Geheimpolizeidokumenten und Gerichtsunterlagen, die der BBC zur Verfügung gestellt wurden, legte den Beweis dar, dass die Spezialeinheiten Mathipa getötet hatten. Diese Dokumente zeigten, dass das Fahrzeug, das Mathipa unmittelbar vor dem Schuss verfolgte, einer Frontfirma der Spezialeinheiten zugeordnet war. Trackingdaten aus diesem Fahrzeug verorteten es an der Tatstelle. Ein Mitglied des Fahrzeugs, Maj Sunnybooi Wambi, erschien zudem an der Szene einer angeblichen Entführung durch Soldaten der Spezialeinheiten.
Der Fall Mathipa verursachte Verwirrung in einer der robustesten Demokratien Afrikas. Es entstanden Befürchtungen, dass die Militärführung des Landes ihre Zuständigkeiten weit überschritt. Als die südliche Armee nach der Verantwortung für Mathipas Tod fragte, gab sie keine Antwort. Die Beweise deuteten auf eine Verstrickung der Spezialeinheiten hin, die für die Ermittlungen zuständig waren, insbesondere im Zusammenhang mit dem Fall eines äthiopischen Mannes namens Abdella Abadigga.
Mathipa untersuchte die Anschuldigung, dass die Spezialeinheiten Abadigga – einen angeblichen militantischen Kämpfer der islamistischen Organisation – als Geheimdienstasset zurück in das Land geschmuggelt hatten. Es gab Hinweise darauf, dass Abadigga „abgedriftet“ war und Johannesburgische Viertel ausbeutete, um Gelder für die islamistische Organisation zu sammeln. Die Ermittlungen konzentrierten sich auf die Anschuldigung, dass die Spezialeinheiten Abadigga im Dezember 2022 entführt und getötet hatten.
Die Dokumente zeigten, dass die Kennzeichen der Fahrzeuge, die bei der Entführung beteiligt waren, einer Firma zugeordnet waren, die als Frontfirma der Spezialeinheiten diente. Ein Treffen zwischen einem Ermittler und hochrangigen Militärs wurde arrangiert, bei dem ihm mitgeteilt wurde, es gäbe keinen Zusammenhang zwischen dieser Firma und dem Militär. Als Mathipa den Fall übernahm, forderte er Zugriff auf alle Details dieser Übung. Kurz vor seinem Tod sagte sein Kommandierender, dass die Personen ihn töten würden.
Nach Mathipas Tod erließen die Spezialeinheiten eine beunruhigende Warnung an die Polizei. In der Warnung besagte die Behörde: „Sie können zehn Ermittler ernennen; wir werden alle töten“. Insgesamt wurden zwölf Mitglieder der südlichen Armee festgenommen, darunter der Oberstleutnant Sunnybooi Wambi und der derzeitige Leiter der Spezialeinheiten. Sie wurden mit Entführung, Mord und anderen Vergehen belastet. Obwohl einige zunächst in Haft waren, wurden sechs der Angeklagten später freigelassen, und drei von ihnen wurden mit beiden Verbrechen in Verbindung gebracht. Die Frage nach der Legitimität der militärischen Operationen blieb unbeantwortet.